Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ccl20O89093 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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