Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx2O08686 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms