Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm11236J3QMS7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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