Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms