Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms