Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprsB0V2N1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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