Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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