Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fscn3Q9QXW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fscn3Q9QXW4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms