Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL26

Fmnl1, Formin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl1Q9JL26 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fmnl1Q9JL26 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms