Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms