Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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