Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms