Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms