Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pfn4Q9D6I3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms