Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7Q9D541 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7Q9D541 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ccdc7Q9D541 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ccdc7Q9D541 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7Q9D541 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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