Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sh3bp5lQ99LH9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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