Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms