Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfcQ8CI19 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfcQ8CI19 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms