Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms