Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms