Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms