Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms