Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms