Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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