Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms