Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmprss11eQ5S248 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms