Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms