Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SvipQ3UZP4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms