Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hvcn1Q3U2S8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hvcn1Q3U2S8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hvcn1Q3U2S8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hvcn1Q3U2S8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hvcn1Q3U2S8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hvcn1Q3U2S8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms