Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms