Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SgcdP82347 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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