Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps11P62281 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms