Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms