Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd22P35329 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd22P35329 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd22P35329 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms