Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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