Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc1P34928 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms