Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnar1P33896 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms