Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 COA6-204ENST00000619305 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL031770.1-201ENST00000430842 851 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC244636.2-201ENST00000448031 1669 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC023302.1-201ENST00000607458 492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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