Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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