Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou3f1P21952 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms