Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NefhP19246 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NefhP19246 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NefhP19246 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NefhP19246 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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NefhP19246 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NefhP19246 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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