Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl9P18340 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms