Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms