Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms