Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms