Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms