Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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