Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms