Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms