Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms